Anatomicko-patologické laboratórium je pracovisko, ktorého hlavnou náplňou je najmä vyšetrenie tkanivových vzoriek odobratých pacientom. Výsledok tohto vyšetrenia podstatne ovplyvňuje rozsah nielen operačného zákroku, ale aj samotnej terapie. Dôležitou súčasťou sú cytologické vyšetrenia, ktorých významnosť je veľmi dôležitá najmä pre diagnostiku a prevenciu. V tomto laboratóriu sú prístroje dobrými pomocníkmi, ale výsledok vyšetrenia je stále produktom kvalifikovaného patológa, ktorý stanoví diagnózu, na základe ktorej lekár určí ďalší postup.